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分有三种：
1、 热水循环式杀菌：杀菌时锅内食品全部被热水浸泡，这种方式热分布比较均匀。
2、蒸汽式杀菌：食品装到锅里后不是先加水，而是直接进蒸汽升温，由于在杀菌过程中锅内存在空气会出现冷点，所以这种方式热分布不是均匀。
3、烤鸭鸡腿灭菌锅淋水式杀菌：这种方式是采用喷嘴或喷淋管将热水喷到食品上，杀菌过程是通过装设在杀菌锅内两侧或顶部的喷嘴中，喷射出雾状的波浪型热水至食品表面，所以不但温度均匀无死角，而且升温和冷却速度迅速，能全面、快速、稳定的对锅内产品进行杀菌，特别适合软包装食品的杀菌。
4、烤鸭鸡腿灭菌锅水汽混合式杀菌：这种方式杀菌由法国推出，巧妙的把蒸汽式和水淋式相结合，锅内加入少量的水以满足循环喷淋使用，蒸汽直接进入国内，真正实现短时高效、节能环保并适合特殊产品的杀菌。
烤鸭鸡腿灭菌锅是采用高温，高压之热水作多种食品的高温快速杀菌处理，食品在装置内连续缓慢回转，使得热传导更迅速更均匀，可以大大缩短整个杀菌过程的时间，从而达到高温短时杀菌处理，稳定产品质量，提高成品率，降低损耗率之目的。烤鸭鸡腿灭菌锅同时可避免食品容易产生过热现象。
烤鸭鸡腿灭菌锅均匀加热和冷却。不论是升温加热过程还是冷却过程，的要求是工艺罐中没有不均匀现象，即需均匀加热或冷却。使用范围广，适应性强，由于控制元件的温度或压力调整范围都比较大，所以，烤鸭鸡腿灭菌锅本套设备可以运用于多种制品之杀菌处理。另外，全部程序不仅可以自动控制，也可以运行手动操作，即人工驱动电器开关、控制阀门、电机的投入与撤出，并可以测试单件动作。停电保护，当设备运行中发生突然停电时，也能保证机器处于安全状态。来电以后，可以人工驱动电器开关，使设备继续投入运行，直到程序结束。